店子镇在南朝宋大明年间（457－464），设白水县。北朝西魏废帝三年（554年），更名永归县。民国二十四年（1935年）。1950年1月，设店子乡，属白龙区公署；1958年9月，实现人民公社化，实行政社合一体制，店子乡改为人民公社。1966年11月，更名为永兴公社，1967年更名店子公社。1984年初恢复乡镇建制至2018年，2018年撤乡并镇更名为店子镇。
店子镇位于剑阁县东南部，东与樵店乡、杨村镇接壤，南与白龙镇为邻，西与龙源镇相连，北与普安镇、木马镇毗邻。店子镇人民政府驻地永兴街109号，今属永兴社区，距县城64公里。幅员面积66.81平方公里，辖及永兴、大河、联盟、元丰、龙水、尖山、登高、石岩7个行政村1社区，35个村民小组。目前全镇3339户，11823人，农业人口2496户，9294人，非农业人口843户，2529人。
店子镇属于亭子口水利枢纽移民大镇，2012年场镇整体搬迁至原大河村三组蒲家坪，占地300亩。拟建了镇政府、学校、卫生院、信用社、粮管所、兽医站、电信营业所、邮政所等单位办公楼。规划并新建设了集贸市场、汽车客运站、污水处理厂、垃圾转运站、自来水厂、公共厕所、路灯、停车场等公共配套设施。同时，投资2000余万元配套复建了过境公路桥梁，交通较为便利。
我镇以移民搬迁为契机，依托厚重的历史文化底蕴和丰富的自然生态资源，辖区内河流水量充沛，湿地资源丰富，亭子湖是建设嘉陵江亭子口水电站形成的内陆淡水湖泊，店子镇段水域面积2万余亩，孕育出了丰富的野生鱼类资源，得天独厚的资源为“渔旅店子”的打造提供了条件。店子镇结合实际，当前，店子镇以打造“渔旅店子”为建设目标，以打造渔旅观光休闲区为出发点，按照“一心、一带、三区”规划着力打造亭子湖畔农渔旅综合服务中心、亭子湖汞河观光休闲带、沿湖农业观光“体验区”、生态渔文化的“体验区”、滨水旅游的“度假区”，奏响渔旅融合发展新篇章，打造渔旅新店子。