因有石马和盐井得名，在三社与踏水交界地方的河里有个像马儿的石头，很久以前这里盐井很多，传说盐井通海，有句谚语“打开石马井、饿死川北人”，解放前是乡，叫石马乡，五十年代撤乡改为太平大队，九十年代恢复老地名，又叫石马井，现有12个村民小组，三条沟，水泥路已通7个村社，还有5个村社未通水泥路，以规划在2016年底各村社全部通水泥路。
2020年村社区调整，将石马井村与大佛寺村合并设立石马井村。
石马井村村委会办公地址为原石马井村党群服务中心；简阳市人民政府批准，批复号为简府函【2020】126号。