1951年原属新庙乡第四保辖区；1951年4月建政时设三合乡楠林村；1958年公社化更名为三合公社楠林管理区，1962年固定后为三合公社楠林生产大队，1983年改公社为乡、大队为村，复名三合乡楠林村村民委员会。
2017年2月14日，四川省人民政府同意撤销三合乡设立牛背山镇（川府民〔2017〕3号）。
2019年12月11日，四川省人民政府关于同意雅安市调整部分乡镇行政区划的批复（川府民政〔2019〕14号）中，撤销新庙，将其所属行政区域划归牛背山镇管辖，牛背山镇人民政府驻楠林村二组18号。
2020年5月12日，《荥经县人民政府关于同意严道街道等乡镇（街道）村级建制调整改革方案的批复》（荥府函〔2020〕34号）后，将保民村合并到楠林村。
楠林村辖10个村民小组。