东汉初平四年（193）分充国县置西、南二充国县，两县境大体以宝马河为分界线。
故推测现三官镇辖区分别属于西充国县和南充国县。
明嘉靖二十一年（1542）南部县共辖9里，现三官镇辖区属于宣化可能性较大。
清道光二十九年（1849）已有三官场，清光绪三十二年（1906）现三官镇辖区属于宣化乡。
清宣统二年（1910）属于建兴乡。
民国24年（1935）置联保处，属于南部县一区。
民国26年（1937）属于增设的南部县第五区。
民国29年（1940）置乡。
民国30年（1941）属于南部县第三区。
民国31年（1942）属于南部县第五指导区。
民国36年（1947）已为三官乡。
[20]1949年解放。
1950年建三官乡，属于南部县第七区。
1958年成立三官公社，属于建兴区。
1966年改名前锋公社，1971年恢复三官公社，1984年改回三官乡，1991年属于建兴区，1992年并入建兴镇，1994年析出置三官镇。
1996年属于建兴区。
2001年南部县撤销区委，区工委，建立督导办。
2004年三官镇属于建兴区。