解放前为盘龙乡5保。
解放后1952年民主建政为群乐乡6村，1958年为红日公社16管理区，1961年编为群乐公社10大队，1983年公社改乡为群乐乡新店子村。
1992年9月撤销群乐乡，新店子村划归巨龙镇管辖，为巨龙镇二十四村。
1994年7月撤群乐乡复建群乐乡，为群乐乡新店子村。
2019年，行政区划调整，将新店子村划归巨龙镇管辖。
2020年，村级建制调整，撤销书房垭村、新店子村，合并设立新店子村（蓬安府发〔2020〕6号）。