1949年属马井乡第10保、第13保、第14保，1950年属马井乡农协会第10分会、第13分会、第14分会；1952年土改建政时，成立义马乡人民政府，为义马乡第10村、第13村、第14村；1956年义马乡并入马井乡，为第1村、第11村、第13村；1958年马井人民公社成立时，为马井人民公社第11耕作区、第13耕作区；1961年体制下放时为马井公社第10生产大队、第12生产大队、第13生产大队；1977年从原10大队（今菠萝村），12大队（今太平村）析出组建马井农科站。
1980年地名普查时命名为菠萝大队、太平大队、红豆大队、农科大队；1983年改公社为乡，大队为村，命名为菠萝村、太平村、红豆村、农科村；1988年11月马井撤乡建镇，属马井镇。
2007年8月由菠萝村、农科村、太平村、红豆村合并为菠萝村至今。