清朝时置枫香、李子园二堡。
枫香堡置于今燕子乡金银村境，因当地曾有大枫香树取名，辖今燕子乡西南境之区域；李子园堡置于燕子乡西北双泉村境，辖今燕子乡西北境之区域。
二堡清代均属嘉川乡。
民国初属白水乡第三（白水）团区。
1933年6月红军于双全村境吴家垭置第六乡苏维埃，废堡。
1935年红军撤离后，属伏溪联堡。
1940年属伏溪乡。
1943年属福庆乡。
1951年分福庆乡西南境置燕子乡，驻地燕子峡。
后迁双泉村境吴家垭，再迁绿化村境寺岭上，隶属旺苍县第五区（1955年8月改称国华区）。
1958年政、社合一为燕子人民公社。
1984年政、社分设置燕子乡。