解放前属越溪乡第5保。
1951年由第5保划出石板屋基、四方碑组建水源村，隶属永建乡。
1958年置水源大队，属越溪管区。
1961年改属永建乡人民公社。
1968年属永建公社。
1978年属永建片。
1980年又属永建公社。
1984年复名水源村，隶属永建乡。
1991年将新联村的第1、4、5村民组划入，名称仍旧，改属玉林乡。
1992年属越溪镇，2020年村级建制调改革整越溪镇黄桷村并入水源村，名称仍旧，改越溪镇水源村至今。