清溪村曾属清平乡，1949年以前为清平乡一、二保。
1950年，废保为村时，改名为永和村。
到土地改革时，又改永和村为清溪村。
1953年，清平、何家两乡合并改名清河乡后划归清河乡。
1958年公社化时改名为七管区。
1961年编制为第七大队，1966年更名为解放大队，1976年复名为七大队。
1981年名清溪大队，1984年定名为清溪村。
2000年8月撤乡建镇为清河镇改属其管辖。
2004年9月8日，经四川省人民政府同意撤销清河镇，其行政区全部合并到友爱镇，因此清溪村至今隶属于友爱镇。