1949年初为金华乡9分会，1958年公社化时为金华公社3大队，1961年为9大队，1980年地名普查时因境内有清凉寺更名为清凉村，2005年5月13日经新津县人民政府批准撤销凉水村、清凉村，组建清凉村。
2014年10月30日经新津县人民政府批准撤销清凉村，设立清凉社区。
地名沿用。
2020年村社区调整，同意将云峰社区与清凉社区合并设立清凉社区。
清凉社区居委会办公地点为原清凉社区党群服务中心；新津县人民政府批准，批复号为新津函【2020】91号。