民国时期，属老林第九保、金垭第二保。
1951年，建政为玲珑乡第一村。
1955年，建社为玲珑乡第一村。
1958年，为金垭公社第四管理区。
1962年，为玲珑公社一大队。
1967年，改为光明公社一大队。
1972年，仍为玲珑公社一大队。
1981年，地名普查时命名为玲珑公社宗祠大队。
1984年，为玲珑乡宗祠村。
1992年，撤区并乡建镇后为黄渡镇宗祠村。
1997年，玲珑乡恢复建制，为玲珑乡宗祠村。
2019年，根据川府民政[2019]9号文件批准，划归黄渡镇管辖。
2020年，村级建制调整，撤销牛心村和宗祠村，合并设立宗祠村（营府函〔2020〕72号）。