民国时期，属老林乡第六保。
1951年，建政改为老林乡第六村。
1955年，改为老林乡改革社。
1958年，改为老林公社十三管理区（人民公社化运动）。
1962年，改为双林公社六大队。
1967年，改为光华公社六大队。
1972年，为双林公社。
1981年，地名普查更名为双林公社黑马沟大队（取消序数地名）。
1984年，更名为黑马沟村（政社分设）。
1992年，撤区并乡建镇双林乡并入老林镇，黑马沟村不变。
1997年5月，恢复双林乡建制，黑马沟村不变。
2019年，根据川府民政[2019]9号文件批准，划归老林镇管辖。