民国时属回龙乡第十四保，1951年建政为新农乡第三村，1955年建社为万寿乡六村十七社，1958年为万寿公社四管理区，1962年为万寿公社六大队，1967年改为增产公社六大队，1972年仍为增产公社六大队，1981年地名普查命名为增产公社三清大队，1984年社改乡时为增产乡三清村，1992年撤区并乡建镇后为回龙镇，三清村，1994年从回龙镇划出恢复建制，名为增产乡三清村。
2019年，根据川府民政[2019]9号文件批准，划归回龙镇管辖。
2020年，村级建制调整，撤销碗水村和三清村，合并设立三清村（营府函〔2020〕72号）。