元至元十七年（1280），设朵甘思宣慰使司都元帅府，治所在今贡觉县莫洛镇。
明朝将朵甘思宣慰使司都元帅府改为朵甘卫指挥使司。
在贡觉县境内设有乃竹万户府。
崇祯十二年（1639），蒙古和硕特部固始汗的部队占据贡觉，设立台吉，十五年，甘丹颇章政权建立后，在贡觉推行宗溪制度，设立馆觉宗。
清雍正四年（1726），清廷组织川、滇、藏三方以宁静山为界，馆觉归甘丹颇章政权管辖。
乾隆十六年（1751），清廷将馆觉划归驻藏大臣直接管辖。
宣统二年（1910），改土归流，将馆觉宗改为贡县，隶属昌都府。
同年冬，设武城县。
1912年，川军进驻贡县、武城县，并将两县划入川边特别行政区。
1917年，藏军占领贡觉地区，西藏地方政府将武城县改设为三岩宗。
1918年，朵麦基巧成立后，将贡县改为贡觉宗，归朵麦基巧。
1928年，民国政府在今四川巴塘设西康政务委员会，将贡县、武城县划入西康政务委员会。
1939年，成立西康省，将贡县、武城县划入西康省。
1950年12月，贡觉宗、三岩宗隶属昌都地区人民解放委员会。
1959年4月，撤销贡觉、三岩宗人民解放委员会，解散宗政府，成立军事管制委员会。
1959年7月，将三岩宗的戈波、支巴、南格、擦拉地方划归宁静宗；其他并入贡觉宗。
1960年1月，国务院正式批准，撤销贡觉、三岩宗，合并设置贡觉县，隶属昌都专区。
2014年10月，撤销昌都地区，设立地级昌都市，贡觉县隶属昌都市。