建村时间不详。
1933年设碧江设治局里吾底乡二保，1950年设碧江县三区一村。
1956年设三区金秀谷乡。
1969年设金秀谷大队。
1981年改属子里甲公社。
1984年设金秀谷乡。
1986年碧江县建制撤销，同子里甲区划属福贡县。
1988年设福贡县子里甲乡金秀谷村公所。
1996年5月金秀谷村委会从甲打一组搬迁到金秀谷村委会下老王组，2009年7月金秀谷村委会从下老王组搬迁到金秀谷村委会金秀谷一组；2000年12月设金秀谷村民委员会，驻金秀谷至今。