2001年4月得名。
解放初属鹤庆县九顶区，1952年属鹤庆县第二区，1956年属辛屯区，1958年人民公社化时划归城郊人民公社属罗伟邑乡，1959年为母屯管理区，1963年撤公社改区，管理区改为小公社为城郊区母屯小公社，1969年至1970年区又改为公社，小公社改为大队为城郊公社母屯大队，1980年初，调整部分生产大队规模，从母屯大队新分出彭屯大队。
1984年撤社改区建小乡为宝顶区母屯乡，1988年，全县开展区乡体制改革，撤区建乡为城郊乡母屯村公所，2000年撤销村公所改村民委员会，为母屯村民委员会，2001年4月撤乡置镇，撤销城郊乡设立草海镇为草海镇母屯村民委员会，名称沿用至今。