娜姑镇位于云南省会泽县西部，东距县城23公里，东接金钟镇、五星乡；南邻大海乡；西濒小江和金沙江，与东川区及四川省会东县隔水相望；北与老厂乡和巧家县蒙姑乡接壤。地理位于北纬26o19＇～26o 35＇，东经103 o 03＇～103 o 14＇，镇境内东西最大横距17公里，南北纵距30公里。镇政府驻地地理坐标为北纬26 o31＇东经l03 o09＇，海拔1920m。系滇、川两省交界的乌蒙山区腹地。
娜姑镇土地总面积264.9平方公里，其中：坝区25平方公里，占土地总面积的9.5 ％；山区239.9平方公里，占90.5 ％。西部边缘为小江断裂带和著名的泥石流区。由于受小江、金沙江的强烈切割，河谷部分岩层垂直裂隙，形成深邃峡谷。整个地势由东北向西南倾斜，呈阶梯式下降，形成三级阶地的小坝子：拖车坝子，海拔2180米，面积7千亩；娜姑坝子，海拔1920米，面积3万亩；干海子坝子，海拔1620米，面积3千亩。境内最高海拔2896米(白龙潭粱子)，最低海拔695米(小河口)，全镇相对高差220l米。
娜姑镇境内群山绵亘，有大小山峰33座，属乌蒙山脉，均为由西北东南走向。其中白龙潭梁子海拔2896米，大竹山海拔2865米，那红山海拔2679米，薄刀岭海拔2410米，莲花山海拔2271米。
主要河流有小江、以礼河及海河，皆属金沙江水系。小江发源于寻甸县清水海，由南向北流入金沙江，全长148公里，下游流经娜姑镇境内28公里，流域面积60.4平方公里，河床高差305米，平均坡度为10.9 ％。以礼河发源于待补镇的野马川，由南向北流经巧家县汇入金沙江，全长122公里，流域面积2558平方公里，河床高差1400米，年均流量15.9立方米／秒。海河发源于娜姑坝子北部，向南流经隧洞后，转向北流经王家山注入小江。全长28公里，年均流量1．24立方米／秒，流域面积191.7平方公里，河床高差为1220米，平均坡度40.3%，有效灌溉面积2121亩。
全镇属南温带高原季风气候，其特点是：夏无酷署，冬无严寒，四季不分明，干湿分明，由于境内地形地貌复杂，海拔相对高差大，立体气候十分明显，各种自然灾害频繁。境内冬季由于受大陆季风气候影响，气候干冷，雨量少，晴天多，风干物燥，年平均气温13.1oC ，最热月7月份月平均气温为19.4oC，最冷月1月份月平均气温5.1oC.。