清系世袭阿朵土千户领有，沿袭十三年。
清康熙年间（1662~1722年），属巧家伙目管辖。
清雍正年间（1723~1735年），为五甲。
民国初期，小河、六合、新店分为上、中、下五甲，小河为下五甲。
民国二十八年（1939年），改七区，辖1镇、4乡、33保、218甲。
民国二十九年（1940年）废区，改称小河镇。
1950年3月，改小河区。
1952年，仍置五区，辖28个乡。
1953年，辖22乡。
1954年，先后将东坪区管辖的红山、纸厂、保坪、黑铁、安邦等乡划归小河区。
1958年，改小河公社。
1961年，设下河区。
1962年，调整规模为小河区。
1963年，析置为小河、新店2区。
1969年，改称小河公社。
1970年，改称小河公社。
1984年，改小河区；红山、保坪、黑铁、纸厂、安邦4个乡划归红山区。
1988年，区改乡，改小河乡。
2002年8月，改小河镇。
2006年，撤销六合乡，将六合、坝统、木厂、马店、四村划归小河镇。