西汉,属益州郡地。
东汉、西晋、东晋属永昌郡地。
南诏属永昌节度地。
宋大理属金齿地。
元属金齿宜抚司。
明为道安安抚司及杨塘安抚司地。
明末清初置六库千总,属大理府云龙县。
清朝乾隆十七年(1752年),白族段姓由清乾隆朝廷封为六库土千总以后,一批白族和傈僳族先后迁至六库周围的半山一带,,使这块地方逐渐得以开发。
段姓土司家族,则集中于老六库。
辛亥革命(1911年)后,析保山县的登埂、鲁掌、卯照、云龙的六库、大兴等地,成立鲁掌行政公署。
民国二十一年(1932年),设泸水设治局,六库为其治地。
1951年2月,改设治局为泸水县,六库为其辖地。
泸水县人民政府成立初期便动员高寒山区一部分农民迁六库,于怒江西岸安家落户。
1957年,成立六库区。
1958年,改为公社。
1983年,复改为区,旋又改为六库镇。