明永乐四年（1406年），设扬塘安扰司，隶云南都司。
弘治和平村九年（1496年）丽江木氏土司占领中甸。
嘉靖八年（1529年），在联合贡下建木氏土司王宫，并派木瓜分驻其地，统领军政大权。
清康熙六年（1667年），被蒙古和硕特部占领，丽江木氏土司势力退出中甸。
四十八年（1709年），中甸自行管理。
四十九年（1710年），中甸划分为五境，其地属小中甸境。
雍正二年（1724年），中甸划归云南。
民国二年（1913年），厅改县，小中甸改为第二区。
1950年5月，建小中甸区。
1958年末，建高原公社。
1962年，调整后仍为区。
1967年，恢复公社。
1984年，恢复区建制，大队改乡。
1988年，区改乡，改小中甸乡，乡改行政村。
2001年，行政村改村民委员会。
2002年7月16日，小中甸乡改小中甸镇。