1949年属南湖乡，同年7月撤乡建区属南湖区，称南店村；1950年春属禹家乡，1956年2月属南湖乡，1956年建南店高级社，1958年10月属南湖公社南湖管理区，称南店生产队，1961年8月属南湖公社，称南店大队；1966年改称胜利大队。
1981年6月恢复南店大队名称，1981年11月属南北湖公社称南店大队，1984年1月称南北湖乡南店行政村。
2000年1月撤销南北湖乡并入高禹乡仍称南店村，2001年1月撤乡建镇属高禹镇仍称南店村。
2012年并镇，属天子湖镇。