建政时，为望里乡护法寺村。
1956年合作化时，属望里乡第二高级社。
1958年公社化时，定名为望里管理区护法寺大队。
1961年隶属望里公社。
1984年改称望里乡护法寺村民委员会。
1988年9月，改称望里镇护法寺村民委员会。
2011年4月撤望里镇，并入钱库镇，为钱库镇护法寺村民委员会。
2016年属望里镇。
2019年苍南县村规模调整，护法寺村、仙居山村合并成护法寺村。
2016年行政区划调整后又归属于望里镇。