民国期间称蒲岐镇,民国后期为蒲岐乡。
1949年12月以蒲岐乡地置蒲岐镇;1956年2月原蒲岐镇、临海、南岳、南联三乡及天成乡的埠头和万桥2村合并设立蒲岐乡;1958年公社化时,原并入的乡、村析出,原蒲岐镇镇成立蒲岐管理区,属蒲岐公社;1961年管理区撤销,改称蒲岐公社;1984年3月,政社分设,改称蒲岐乡,属虹桥区;1985年4月改为建制镇;2011年5月,蒲岐镇建制撤销,其行政区域并入虹桥镇;2015年12月,虹桥镇调整管辖范围,增设蒲岐镇。