明嘉靖时属芳山乡三十二都。
1931年分置咸丰、芳垟、东瑶、龙庄4乡；1935年咸丰、芳垟乡合置咸芳乡，1945年东瑶、龙庄乡合置瑶庄乡；1946年咸芳乡、瑶庄乡合置芳庄乡，属陶山区。
1949年析置咸芳乡、周垟乡、瑶庄乡，1958年周垟乡并入咸芳乡。
1958年9月分别改称咸芳生产大队、瑶庄生产大队（1959年分改为咸芳管理区、瑶庄管理区），属湖岭公社；1961年改建为咸芳人民公社、瑶庄人民公社，属湖岭区；1984年取消人民公社，复置咸芳乡、瑶庄乡，仍属湖岭区；1992年撤区扩镇并乡，瑶庄乡与咸芳乡合置芳庄乡；2011年并入湖岭镇；2015年12月复置芳庄乡。