原上院、坑尾庵2村解放初至1956年属泗溪乡，1956至1958年属金溪乡；1956年上院建立农业生产合作社曾名“新星”。
1958年上院建立新星生产队，坑尾庵为下桥生产队一部分，均属泗溪公社泗溪生产大队；1959年2月属泗溪公社泗溪管理区。
1961年9月改为新星、坑尾生产大队，属规模调整后的泗溪公社；1981年新星大队更名上院大队，坑尾大队更名坑尾庵大队。
1984年5月改为上院、坑尾庵行政村，属泗溪乡。
1992年泗溪乡被撤销，属泗溪镇。
1992年重新认定革命老区，原坑尾庵村被认定为革命老区村。
2004年原上院、坑尾庵2村合并组建为新的上院村。