1979年仙居县为保障城镇人民蔬菜供应，成立城关蔬菜专业村，将由原城关第四选区、第九选区部份生产队组成城关蔬菜大队；1983年改队建村改为城关蔬菜村；1993年因城南工业开发区征地，村民就地农转后，为仙居县城关镇第五居民委会；1997年城关镇按地名调整居委会时，因驻地在黎明路而命名为黎明居委会；2003年12月为理顺城区基层管理体制，发挥社区管理作用，撤销居委会，成立仙居县南峰街道水孔头社区居民委员会，沿用至今。
2013年社区居委会的批复撤销水孔头村村委会、黎明居委会，设立水孔头社区居委会，社区居委会办公地址设工业东路2号原水孔头村办公楼。