建国后建立大垟行政村,隶属于黄源乡;1958年公社化时称大垟生产队,隶属于和平管理区;1961年体制下放建大垟大队,隶属于和平公社;1981年和平公社改称黄源公社,隶属于黄源公社;1984政社分设改设大垟村村民委员会,隶属于黄源乡;2011年9月黄源乡并入崇头镇,隶属于崇头镇。
2019年5月,根据《云和县人民政府关于同意崇头镇部分行政村规模调整的批复》(云政函〔2019〕31号),同意合并大垟村、贵庄村、盘条口村、坑下村等4个村民委员会,建立大垟村村民委员会,隶属于崇头镇。
名称至今沿用。