晚清时期，本县共划为12团69保，三元归大木团五谷庙联保管辖；民国20年，贺龙率红三军来房县，开辟了以房县为中心的鄂西北革命根据地，建立县、区、乡苏维埃政权，三元归五区大木厂乡管辖；民国25年，废联保为乡，仍为5个区，三元归大木长乡管辖；民国33年，将大木厂镇更名为大公镇；民国37年，恢复土城区署，辖大公镇等3乡；1949年，房县解放，8月起，先后建立大木等10个区，三元归大木区管辖；1951年，中共大木区委专门召开群众大会，追认乔三元为革命烈士，并将三元居住的红马乡改名为“三元乡”；1952年为房县四区三元乡；1958年为大木公社大木街管理区三元大队、东坡大队、前进管理区柳林大队；1961年为大木区大木公社三元大队、东坡大队、前进公社柳林大队；1975年3月为大木区大木公社三元大队、柳林大队、东坡大队；1984年6月为大木区大木镇三元村、东坡村、马进洞乡柳林村；1987年11月为大木镇大木办事处三元村、东坡村、马进洞办事处柳林村；1989年4月为大木镇大木办事处三元村、东坡村、马进洞管理区柳林村；2000年10月24日三元、东坡合并为大木厂镇三元村；2002年小村并大村，原三元村、柳林村合并为大木厂镇三元村，下辖4个村民小组。
1931年贺龙率红军主力到大木，乔三元河红军一道生擒匪首刘成禄，9月初乘贺龙率主力东下洪湖之机，乔三元被大刀会杜明祥、杨焕清等匪徒杀害，1961年中共大木区委，召开群众大会，追认乔三元为革命烈士，并将原来的红庙村改为三元村以做纪念。
2002年合村并组，由原自然村三元村、柳林村、东坡村合并为现在的三元村。
辖区有千佛洞、灶儿岩、铁索关、点将台、射箭崖等旅游景点。