小吕庄村形成于明末清初。
清宣统年间，隶属襄阳县第八区（双沟）辖。
民国9年（1920）属襄阳县第十一区；民国19年（1930）属第五区（双沟）；民国21年（1932）属第九区；1947年冬，属桐柏军区第三军分区程河爱国民主区政府；1948年2月属襄阳县第九区；1949年1月，属襄阳县新七区（双沟）；1950年4月，属程河区；1953年4月属第十区；1954年12月属程河区；1956年3月，属双沟区，同年，成立小吕庄高级合作社，9月，属程河区；1958年9月设小吕庄大队，属程河乡（亦称红星公社）管辖；1958年12月属双沟人民公社；1961年6月属程河区；1975年11月属程河人民公社；1984年3月设小吕庄村村民委员会，属程河区管辖；1987年9月属埠口乡管辖；1996年4月属埠口镇管辖；2001年3月，乡镇合并，属程河镇管辖。
该地名沿用至今。