药王山遗址位于赤峰市红山区文钟镇药王庙村东,遗址形状为椭圆形,西北坡较陡,西南坡较缓,面积约12000平方米。
药王山遗址的考古研究工作始于1960年,1960年春中国社会科学院考古研究所内蒙古工作队在此发掘药王庙遗址,试掘简报发表于《考古》1961年第2期。简报提出了两种文化的看法,即“夏家店下层文化”、“夏家店上层文化”,从此夏家店文化蜚声海内外。药王庙遗址的发掘是确立夏家店下层文化和夏家店上层文化的主要遗址之一。
2014年被自治区人民政府公布为第五批自治区重点文物保护单位。