1951年，属第三行政区，为巴沟乡和卡力岗乡。
1953年，由同德藏族自治区改为同德县以后，巴沟为当时同德下设6区中的一区。
1956年10月至1957年底，重编为第五区（巴沟）。
1958年3月，撤区并乡时巴沟、卡力岗合并为巴沟乡，同年10月，改巴沟乡公社。
1963年，分为松多、巴沟、卡力岗3个农业公社。
1965年，将原有的卡力岗公社、松多公社、巴沟公社合并为巴沟乡。
1970年，改为巴沟人民公社。
1984年4月，复为巴沟乡。