民国时期属双河乡第7保;建国后1951年建政为双河乡第7村;1955年建社为双河乡鲜花先进7、8、9、10社;1958年为双河公社10管理区;1962年为双河公社10大队;1967年为齐心公社10大队;1972年仍为双河公社10大队;1981年地名普查命名为双河公社福祠大队;1984年为双流乡福祠村;1985年为双流乡福祠村;1992年撤区并乡建镇后,仍为双流镇福祠村。
2020年,村级建制调整,撤销松树村和福祠村,合并设立福祠村(营府函〔2020〕72号)。